粪菌移植，是从健康供体的粪便中提取出特定菌群，配型培养后通过一定方式（口服（FMT-C）、灌肠（FMT-L）等）移植到受体肠道中，重建受体的肠道微生态系统，从而达到干预、治疗肠道/肠道外疾病的一种新技术。
粪菌移植通常也被称为“菌群移植”(FMT)，粪菌移植是肠道微生态领域的一项非限制类医疗新技术，通过重建肠道微生态进行各类疾病的干预治疗，是将健康人粪便中的功能菌群通过一定方式移植到患者肠内，以调节肠道菌群失衡，重建具有正常功能的肠道微生态系统，达到对肠内肠外疾病的治疗或辅助治疗作用。
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